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neurali:nest

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neurali:nest [2016/06/29 07:48]
profpro
neurali:nest [2020/06/08 22:20] (current)
Line 1: Line 1:
 +======NEST======
 +http://www.nest-initiative.org/?page=Software
  
 +sorgenti: {{neurali:nest-2.6.0.tar.gz}}
 +
 +=====Introduzione PyNEST=====
 +
 +Si usano API Python per poi generare automaticamente codice in linguaggio SLI, che servirà per **simulare** una rete dal punto di vista dei neuroni. NEST viene usato come interprete SLI per eseguire la vera e propria simulazione.
 +
 +Se si chiama h il passo temporale discreto minimo (risoluzione) della simulazione, allora lo stato di ogni neurone è aggiornato ogni passo h. Gli impulsi (Spike) vengono inoltrati tra neuroni per multipli superiori di questo intervallo.
 +Durante la simulazione, la propagazione dei segnali tra neuroni può avvenire interamente all'interno di un intero passo h. Questo impedisce interruzioni e interferenze tra neuroni e garantisce sincronizzazione.
 +
 +Se necessario, è possibile comunque analizzare il segnale anche all'interno di un passo h, usando modelli di neuroni che terminano con la sigla "ps" (post-synaptic?)
 +==== Per iniziare ====
 +Una rete per poter essere simulata deve essere composta da
 +
 +  * **nodes**, di tre tipi:
 +    * neurons: possono utilizzare diversi modelli matematici (//iaf_neuron//) http://en.wikipedia.org/wiki/Integrate-and-fire
 +    * devices: sono dispositivi virtuali per effettuare input/output (//multimeter//, //generator//)
 +    * sub-networks: sono root, layer, column, area
 +  * **connections**, di 7 tipi, specificati successivamente.
 +
 +
 +===Funzioni===
 +
 +  *//nest.Create//, crea un nodo (o una lista di nodi) e specifica le caratteristiche di un nodo.
 +  *//nest.Connect//, collega due nodi (o due liste di nodi) e specifica come vanno collegati:
 +    * modello di sinapsi
 +    * modello di connessione (maglia completa, maglia incompleta, uno ad uno, ecc.)
 +
 +====Installazione====
 +
 +===Dipendenze===
 +
 +Utilizza i seguenti pacchetti:
 +  * libreadline-gplv2-dev (oppure libreadline5-dev), make, g++
 +  * libgsl0-dev, gsl-bin, gambas3-gb-gsl
 +  * openmpi-common, libopenmpi-dev, libopenmpi1.6
 +
 +comandi per l'installazione
 +
 +  ./configure --prefix=/usr/local
 +  make
 +  make install
 +
 +----
 +
 +
 +  * [[neurali:nest modelli]]
 +  * [[neurali:nest tutorial1]]
 +  * [[neurali:nest tutorial2]]
 +  * [[neurali:nest tutorial3]]
 +  * [[neurali:nest tutorial4]]
 +  * [[neurali:nest parallel computing]]
neurali/nest.txt · Last modified: 2020/06/08 22:20 (external edit)